بدرالدین حقانی فرزند سوم "جلال الدین حقانی"، بنیانگذار گروه حقانی، است.
اگرچه بعد از مرگ جلالالدین حقانی، سراج الدین حقانی فرزند ارشد او جانشین پدرش شد و رهبری این گروه را به عهده گرفت اما آگاهان امور معتقدند که عملا، بدرالدین حقانی، فعالترین عضو این گروه بوده است.
او در جمعآوری پول، رهبری عملیات و اداره فرماندهان گروه حقانی، بهطور رسمی اداره امور را به عهده داشته است.
گروه حقانی در سالهای اخیر، بزرگترین عمیات را در افغانستان علیه ناتو و آمریکا رهبری کرده است.
حمله به هتل اینترکنتیننتال کابل، در ماه ژوئن ۲۰۱۱، حمله به سفارت آمریکا در کابل در ماه سپتامبر ۲۰۱۱ و همچنین حمله همزمان به چند هدف مهم در شهر کابل در سال ۲۰۱۲ از اقداماتی است که گروه حقانی مسئولیت آنها را به عهده گرفته و مقامهای ناتو و افغان نیز گفتهاند که این حملات کار گروه حقانی بوده است.